это проблема настройки клиентов ftp, которыми пользуетесь:
http://forum.ruweb.net/viewthread.php?tid=158

Total Commander:
1. net - ftp - show hidden files
2. в файле wcx_ftp.ini в разделе [General]
вписать FtpShowHidden=1 и перезагрузить Total Commander.

Far:
[x] Расширенный список:
LIST -la

Far Navigator:
Custom List command
LIST -la

Cute FTP:
Filter Setting Page
Server side filtering
remote filter: -la


[Отредактировано 15.6.2012 кто timru]