Привет.
Как в Директ админе:

1. Ограничить место для субдоменов?

2. написать строку доступа по ftp для следующего юзера:

Account:qqq@domain.info
password:qqq
Server Path:/home/domain/subdomain/

???
т.е. для
Account:qqq@domain.info
password:qqq
Server Path:/home/domain/

работает:
ftp://qqq@domain.info:qqq@domain.info

а для первого случая - уже нет.

проверл варианты:
и так: ftp://qqq@domain.info:qqq@subdomain.domain.info

и даже так:
ftp://qqq@subdomain.domain.info:qqq@domain.info

С фтп разобрался.
Вопрос про место - остается.

Присоединяюсь к вопросу про субдомены.
Можно ли ограничивать их размер?

нет, естественно

"нет, естественно"
ничего естественного здесь не вижу...

Это типа, чтоб не исползовать обычный тарифный план как реселлерский?

Ну с это благородной задачей вы молодцы справились.

А если нет у меня ацкозлых умыслов. Тогда - как?

нет здесь никаких злых умыслов и происков врагов.
Заводите тогда новый хостинг-аккаунт с именем поддомена и настраиваете DNS основного домена на этот хостинг аккаунт.

Это типа потому что *nix системы так устроены.
Квота на диск задается для каждого аккаунта (пользователя) а не для папок. Один аккаунт - один лимит.