такой вопрос:
Я припарковал себе домен второго уровня flaemail.ru, но почтовый адрес получается только третьего уровня box@flaemail.ruweb.ru.
Как сделать чтобы было box@flaemail.ru.

сменить flaemail.ruweb.ru на flaemail.ru
или добавить flaemail.ru как отдельный ("дополнительный" а не "паркованный" домен

как настроить электронную почту?

http://site-helper.ru/email.html#create