Данная проблема в том, что по какой-то причине упал mysqld и панель управления загрузилась после этого, соответственно, она его больше не "видит". Лечится:

1) убедитесь, что mysqld запущен и в случае необходимости (пере)запустите его:
выполнением следующей команды в консоли из под root-а:

/usr/local/etc/rc.d/mysql-server restart

2) выполните несколько раз до появления сообщения "No matching processes were found" команду:

killall ispmgr

Либо же можете в такой ситуации просто перезагрузить весь vds целиком, тоже поможет.