Я создаю новый FTP-аккаунт (в DirectAdmin) с доступом только в public_ftp. Как ограничить для него доступ по FTP только на чтение?

поставить на папку права 555. иного способа не вижу

А можно ли как нибудь задать лимит размера файлов на загрузку в эту папку если запись разрешена?
через .htaccess нереально?

нет

> поставить на папку права 555
при этом сервер туда не может писать, вроде бы...